از آنجا که کربن فعال دارای الزامات بالایی برای پیش درمان آب است، و قیمت کربن فعال گران است، در تصفیه فاضلاب، کربن فعال عمدتاً برای حذف آلاینده های ردیابی در فاضلاب برای رسیدن به هدف تصفیه عمیق استفاده می شود. فاضلاب روغنی از پالایشگاه اولاً با جداسازی نفت، فلوتاسیون هوا و تصفیه بیولوژیکی، و سپس تصفیه پیشرفته توسط تصفیه شن و تصفیه کربن فعال درمان می شود. محتوای فنل فاضلاب از 1/0 میلی گرم در ليتر (پس از درمان بیولوژیک) به 005/0 میلی گرم در ليتر کاهش یافت، محتوای سیانید از 19/0 میلی گرم در ليتر به 048/0 میلی گرم در ليتر کاهش یافت و COD از 85 میلی گرم در ليتر به 18 میلی گرم در ليتر کاهش یافت.